新疆大学建筑工程学院土木工程系前身为新疆工学院建筑工程系的结构、力学和施工教研室，成立于1977年。现有土木工程和工程管理两个本科专业，一个土木工程一级学科硕士点，建筑与土木工程、工程管理两个专业硕士学位点和一个工程硕士学位授权点，并且结构工程为自治区重点学科（培育），防灾减灾与防护工程为校级重点学科。现有教职工42人，其中自治区教学名师1人，校级教学名师1人，土木工程专业指导委员会委员1人，宝钢教育奖获得者2人，教授5人，副教授（含高工）15人，讲师15人，实验人员6人。具有博士学位6人，硕士学位24人。取得全国一级注册结构工程师等各类全国注册工程师资格20余人次。

土木工程专业（建筑工程方向）于1978年开始招收本科生，工程管理专业于2004年开始招收本科生，其中土木工程专业为自治区人才急需紧缺专业、国家级高校特色专业，2014年5月通过全国土木工程专业评估，在全国500多个设有土木工程专业的高校中排名第78位。土木工程系现有1个自治区级教学团队，1个区级实验教学示范中心，2门区级精品课程，3门校级精品课程。现有在校本科生700余人。

土木工程系现有结构、力学、建材和土工4个实验室，能够满足本科实践教学需要。结构试验大厅面积1600平方米，建有墙厚4.6m、高12m的新疆独家拥有的反力墙，新疆最大的加荷架系列，现共有设备523台件，总价值1200余万元，其中拥有从美国MTS公司采购的价值450万元6个拟动力作动器试验设备系列，以及价值60万元、行程为4.5m、可施加500吨压力的长柱压力机等。

土木工程系近年来共承担科研项目80多项，其中国家级项目14项，省部级项目12项，厅局级项目10项，横向课题27项，经费多达1000余万元。编写普通高等教育“十一五”国家级规划教材6部，发表学术论文200多篇。获自治区教学成果奖一等奖1项，自治区科技进步奖2项，自治区优秀论文奖8项。土木工程系获得自治区教育工会“教育先锋号”和自治区总工会“工人先锋号”荣誉称号。

近年来组织开展多项本科生实践教学活动，近年来学生参与主持“国家大学生创新性实验计划”项目28项，发表学术论文30余篇。在国家级大学生“挑战杯”竞赛、全国大学生结构设计竞赛、BIM大赛、全国周培源大学生力学竞赛等大赛中多次获奖。多人获“中国土木工程优秀毕业生”、“徐芝纶力学优秀毕业生”称号。毕业生深受用人单位好评，供需比保持在1：6以上。

四十年的励精图治，沧桑砥砺，土木工程系秉承“厚基础、宽口径、强能力、高素质”的教学思想，经过不懈的努力，取得了令人瞩目的成绩。