新疆大学建筑工程学院的前身是原新疆工学院建筑工程系，成立于1977年，2000年12月新疆工学院与新疆大学合并组成新的新疆大学，2001年4月新疆工学院建筑工程系更名为新疆大学建筑工程学院。

新疆大学建筑工程学院是新疆高校建筑工程高等教育领域教学科研力量最为雄厚、专业门类最为齐全的工科学院。根据中央关于开展新一轮对口支援新疆工作的精神，同济大学全面对口支援新疆大学建筑工程学院。

学院下设四个系（土木工程系、建筑与城市规划系、城市建设系、测绘工程系），一个中心（实验中心），七个专业（土木工程、建筑学、城乡规划、测绘工程、工程管理、建筑环境与能源应用工程、给排水科学与工程），其中，土木工程专业下设工业与民用建筑、道路与桥梁、隧道与地下工程、智能建造4个方向。

土木工程、建筑学、工程管理专业为国家一流本科专业建设点，城乡规划、建筑环境与能源应用工程专业为自治区级一流本科专业。土木工程是自治区首个通过国际工程教育认证专业、国家特色专业；建筑学是自治区唯一两轮通过全国高等学校建筑学专业评估专业；土木工程、建筑学、城乡规划、测绘工程是自治区人才急需紧缺专业。同时，学院现拥有土木工程一级学科博士点、资源与环境专业学位博士（测绘工程方向）授权点，土木工程和建筑学2个一级学科硕士点，土木水利（建筑与土木工程、测绘工程）和工程管理2个专业学位硕士授权点。

学院共有教职工132人，专任教师人数为105人，实验技术人员15人，其中高级职称比例为57%。学院共有4个省部级科研平台，2个省部级教学平台。学院实验中心实验室总面积11000平方米，现共有各类设备1000余台套，总价值约1亿元。2025年7月已完工建成台面尺寸6m×6m、三向六自由度的地震模拟振动台并投入使用。

“十四五”期间，建筑工程学院获批省部级及以上纵向科研项目93项，含获批立项国家自然科学基金项目19项、自治区科技援疆计划1项、自治区杰出青年科学基金1项、自治区揭榜挂帅项目2项、自治区自然科学基金重点项目2项、自治区重点研发专项8项。实现社科类项目立项突破，斩获国家社会科学基金项目1项、国家社会科学基金项目-重大项目-重大招标项目子课题1项、教育部人文社会科学研究项目1项、国家民委民族研究项目1项、自治区社会科学基金项目1项、自治区社科联项目1项。学院与中建三局、中铁十五局集团城市轨道工程有限公司、上海市政工程设计研究总院(集团)有限公司等80余家大中型企业建立了长期合作关系，承担横向项目335余项，合同经费达7222万元。“十四五”期间科研总经费11970万元，实际到账经费6622万元。学院获省部级科技奖3项（2021年获自治区级科技进步二等奖1项，2023年获自治区科学技术奖二等奖1项，2024年获自治区科学技术奖二等奖1项）。学院以新疆大学为第一单位发表C类及以上高水平论文374篇，出版学术专著6部，产出发明专利10项，实用新型专利120项。

学院根据专业领域前沿及服务重大产业的需求，以具有博士学历或高级职称及学术业务骨干为科研团队带头人，组建13个研究团队，分别为：“结构抗灾韧性与工程咨询”、“岩土稳定与工程防治”、“材料耐久性与运维工程”、“新材料应用与组合结构”、“工程结构损伤与多尺度分析”、“绿色与节能建筑”、“城市设计与住区更新 ”、“文化遗产保护与本土建筑”、“城乡国土空间规划与乡村振兴” 、“测绘与地理信息”、“水安全保障与智慧水务应用”、“建筑环境营造与能源应用技术”、“道桥及大跨结构”。